L'année 1973 au Chili, deux enfants âgés de 11 ans vont faire connaissance sur les bancs d'une école. L'un s'appelle Pedro Machuca, le fils de paysans qui survit dans un bidonville et l'autre est Gonzalo Infante, timide et issu d'une famille aisée. Cette initiative, qui vient du père Mac Enroe, consiste à apprendre le respect et la tolérence aux jeunes en mettant ensemble dans un collège catholique de Santiago des éléves de différentes classes sociales...